Au niveau des individus
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Si un gène est fréquent, le mariage consanguin ne modifie pas la probabilité d’être hétérozygote.
Plus ce gène est rare, plus le mariage augmente le risque d’homozygotie.
Problématique dans le cas des maladies dues à un gène récessif, mais avantageux s’il s’agit d’un « bon gène » (les éleveurs contractent des mariages consanguins pour conserver les gènes avantageux).